额叶脑膜瘤

注册

 

发新话题 回复该主题

筛选TCGA数据库中低级神经胶质瘤微环境 [复制链接]

1#

AnnTranslMed

IF:3.

Publishedin.3.8

Introduction

肿瘤微环境(TME)是肿瘤灶所在的细胞环境。它由内皮细胞,炎性介质,间充质细胞以及免疫细胞和基质细胞组成。其中,免疫细胞和基质细胞是两个主要的非肿瘤成分,在癌症的诊断和预后中具有重要意义。LGG肿瘤细胞形成了肿瘤微环境的复杂环境,最终促进了肿瘤细胞转录组的适应性和疾病进展。另一方面,研究表明TME可通过调控基因表达对肿瘤恶性程度及临床预后产生重要影响。

为了在LGG中通过ESTIMATE评估观察到TME特性,作者通过使用LGG人群的TCGA数据库和从ESTIMATE算法获得的免疫评分,提取了一系列预测LGG患者预后不良的微环境相关基因,更重要的是,作者开发了一个风险评分系统评估中心基因的预后价值。此外,还探索了中心基因与免疫浸润之间的相关性。

Result01免疫评分和基质评分与LGG亚型,肿瘤等级和生存结果相关

表1

TCGA共收集条LGG肿瘤数据。然后,作者筛查了例以-01结尾的样本,代表原发实体瘤。其中,作者删除了样本TCGA-CS--01和TCGA-R8-A6YH-01,因为作者无法获得这些样本的生存信息。

最终从TCGA数据库中提取LGG样本份,其中男性份(55.45%),女性份(44.55%)。LGG患者的临床特征见表1。

图1

免疫评分、基质评分和估计值分别在/p>

分享 转发
TOP
发新话题 回复该主题