脑胶质瘤PABPC1相关生物信息学特征及 [复制链接]

4December

FutureOncol.

IF：2.7

ABSTRACT

胶质瘤是成人最常见和最致命的脑肿瘤。根据年更新的WHOCNS分类系统，结合组织学和分子参数，胶质瘤可分为以下几种类型：具有异柠檬酸脱氢酶（IDH）突变的低度胶质瘤（LGG），带有或不具有1p/19q编码的LGG，具有IDH野生型亚型的LGG，是否具有IDH突变的多形性胶质母细胞瘤（GBM)。为了提高胶质瘤患者的诊断准确率和治疗效果，寻找新的生物标志物和治疗靶点至关重要。

RNA结合蛋白是多功能的，可以与许多分子相互作用。RNA的多腺苷尾可以被RNA多聚（A）结合蛋白（PABPs）特异结合。PABPs对于启动mRNA的翻译和稳定至关重要。在人类中，PABPs至少包括三种功能蛋白：PABP1、诱导PABP（iPABP）和PABP3。其中，PABP1蛋白由PABPC1基因编码。在许多癌症中，PABPC1的过度表达促进肿瘤的进展和转移，如食管癌、胃癌、滤泡性甲状腺癌、膀胱癌等。然而，关于PABPC1在胶质瘤中的遗传和表观遗传学特征知之甚少。

为探讨PABPC1在胶质瘤中的临床和分子特征，我们以中国胶质瘤基因组图谱（CGGA）数据集中的基因表达数据作为训练集，并在肿瘤基因组图谱（TCGA）数据集中进行验证。我们发现PABPC1在恶性程度较高的胶质瘤中表达下调，而PABPC1在神经前亚型中高表达，在胶质瘤患者中显示出有益的作用。本研究为胶质瘤患者提供了一个潜在的治疗靶点。

MaterialandMethods

本研究采集的样本

在CGGA数据集中(